1.顱內出血、窒息
敗血症有呼吸暫停、震顫、抽搐、前囟凸出、表示有神經系統侵犯時,尤其是初生1周內患兒,應與顱內出血、窒息等鑑別。後者發病早,多在生後1、2天內起病,有產傷史。有神經系統先天畸形併發腦膜炎時,也應與敗血症鑑別。
2.呼吸道疾病
敗血症早期症狀可有呼吸困難、急促、發紺等,應與氣胸、肺炎、未成熟兒原發性呼吸窘迫綜合徵、肺膨脹不全等鑑別,必要時可攝胸部X線片以協助診斷。
3.消化道疾病
腹脹、嘔吐、大便次數多或減少,是腸道原發病的表現,也可在敗血症時出現,應分析各症狀的發展和因果關係。對腸菌類引起的敗血症應提高警惕。
4.血液病
新生兒溶血病、紅細胞酶的缺乏也可表現黃疸、貧血、呼吸急促和呼吸困難等,但嚴重的溶血性貧血並無感染徵,可與敗血症引起的高膽紅素血癥鑑別。新生兒出血症須與敗血症併發出血者鑑別,前者無感染灶,輸血和維生素K治療可獲痊癒。特發性血小板減少性紫癜和先天性白血病應與敗血症鑑別,可由血常規檢查協助診斷。