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胚胎停育是指妊娠早期胚胎因某種原因所致發育停止。B超檢查表現為妊娠囊內胎芽或胎兒形態不整，無胎心搏動，或表現為妊娠囊枯萎。臨床屬於流產或死胎的範疇。造成胚胎停育的原因很多。
精子問題 環境汙染、食品安全以及輻射等因素正在損害著男人的精子，造成2 流產男人急劇增加。精子DNA碎片化檢測這些新興技術推廣程序卻非常緩慢，精子核內的染色體承載著人類個體的遺傳密碼，當人類精子與卵子結合形成受精卵時，精子即將核內的遺傳資訊傳遞給子代，保證胚胎髮育。因此，精子染色體畸變或精子核不成熟，均可導致胚胎髮育異常或終止，是造成女性流產的最常見的男方因素。精子DNA碎片化檢測3 是評價精子核功能狀況的最新方法之一。因此一般建議胎停後首先排查男方原因，檢查男方的精子畸形率以及精子DNA碎片率4 簡稱DFI，也就是精子DNA碎片化檢測。
內分泌失調 胚胎著床及繼續發育依賴於複雜的內分泌系統彼此協調，任何一個環節失常，都可致流產。胚胎早期發育的時候，需要三個重要的激素水平，一個是雌激素，一個是孕激素，一個是人絨毛膜促性腺激素，作為母體來講，自身的內源性激素不足，就滿足不了胚胎的需要，就有可能造成胚胎的停育和流產。其中最常見的是黃體功能不良，黃體功能不全可造成子宮內膜發育遲緩和黃體期短，從而影響受精卵的種植，或早期妊娠流產。黃體功能不全者常伴有其他腺體功能異常，如甲狀腺功能亢進或減退、糖尿病、雄激素相對增多症及高泌乳素血癥等，這些因素均不利於胚胎髮育，與流產密切相關。
免疫因素 妊娠宮內的胚胎或胎兒實屬同種異體移植，因為胎兒是父母的遺傳物質的結合體和母體不可能完全相同。母--胎間的免疫不適應而引起母體對胎兒的排斥。常見的自身免疫疾病為系統性紅斑狼瘡、硬皮病、混合性結締組織病、皮肌炎等。其二是生殖免疫的問題，如果我們自身帶某種抗體，就有可能影響胚胎的發育。實際上抗體的檢測每個醫院是不太一樣的，醫生的觀點也不太一樣，從我們研究的角度來說，認為影響因素有四個，一個是抗精子抗體，如果要有的話，有可能會抵制精卵結合;第二，是抗子宮內膜抗體，如果存在抗子宮內膜抗體的話，有可能會影響胚胎的發育，抵制胚胎的發育;第三是抗卵巢抗體，如果要有，會影響卵子的質量;第四是叫抗絨毛膜促性腺激素抗體，這個激素實際是精卵結合之後七天就要分泌的一個重要的激素，但是如果自身有這種抗體的話，就會抵制激素的分泌，就有可能造成胚胎的停育。
子宮異常 子宮裡的內環境和子宮整體的環境都有可能對胚胎有影響。內環境就是子宮內膜，如果太薄、太厚都會影響著床。由於子宮缺陷引起的流產約佔10%~15%，常見的有1先天性苗勒氏管的異常包括單角子宮、雙子宮及雙角子宮致宮腔狹小，血供受到限制。子宮動脈發育異常可導致蛻膜化不同步和種植異常。2宮腔粘連，主要由宮腔創傷、感染或胎盤組織殘留後引起宮腔粘連及纖維化。阻礙了正常蛻膜化和胎盤種植。3子宮肌瘤及子宮內膜異位症引起血供減少導致缺血和靜脈擴張，蛻膜化不同步，種植異常以及肌瘤造成的激素改變也會引起妊娠的失敗.4先天性或損傷性宮頸內口鬆弛以及胎內接受乙烯雌酚治療致宮頸發育異常常致中期妊娠流產。
