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抗生素治療
出現化膿性扁桃體炎時通常採取抗生素治療，例如：青黴素、頭孢曲松、氧氟沙星等，一般來說三天左右即可得到有效緩解。
不過抗生素的使用必須的醫生的指導下進行，因為部分抗生素帶來的副作用會影響到小孩的生長髮育，例如：18歲以下兒童禁止使用左氧氟沙星，否則會抑制骨骼的正常發育。
針灸療法
化膿性扁桃體炎的經絡感測主要是肺經和腎經，所以中醫中可以採用針刺洩腎經和肺經的穴位取得較快的治療效果，常刺穴位包括：築賓穴、太溪穴、少商穴、商陽穴，一般來說針刺後可以立刻止痛，數小時後可以退熱。
築賓穴：在小腿內側，當太溪穴與陰谷穴的連線上，太溪穴上5寸，腓腸肌肌腹的內下方。此穴可以散熱降溫。
太溪穴：太溪穴位於足內側，內踝後方與腳跟骨筋腱之間的凹陷處，此穴可以滋陰益腎，壯陽強腰。
少商穴：少商穴位於拇指橈側指甲角旁0.1寸。常用於治療肺炎、扁桃體炎、中風、昏迷、精神分裂症等。
商陽穴：該穴位於人體的手食指末節橈側，距指甲角0.1寸。主要治療耳聾，齒痛，咽喉腫痛，頜腫，青盲，手指麻木，熱病，昏迷等疾病。
對症治療
化膿性扁桃體炎通常有高熱、全身痠痛的症狀，這個時候可以使用解熱鎮痛的藥物治療，這類藥物既能夠解熱鎮痛，有對抗菌有一定的作用。
手術治療
如果扁桃體化膿頻繁發作，且扁桃體肥大時影響到了正常的呼吸和吞嚥功能，或者引起了腎小球腎炎、心肌炎、關節炎等併發症，建議對扁桃體採取切除治療，這樣既能夠使扁桃體化膿得到較快的治療，又能夠防止扁桃體化膿反覆發作。
生大黃煮水
生大黃15克(小兒劑量10克)，加沸水250毫升沖泡，候溫慢慢嚥服。每隔l小時沖泡1次，1劑可連泡4次。
生大黃泡水有清熱解毒的作用，主治急性化膿性扁桃體炎，大便秘結，咽喉腫痛等。體虛、孕婦及婦女經期、哺乳期忌用。
中藥水煎服
蒲公英、板藍根、魚腥草、臭靈丹、白茅根、銀花、菊花各20克，任選其中2～3味，水煎服，每日一劑，分4～5次服用。
桔梗根泡水
夏天時，挖掘其根，以水洗淨，風乾後，可當藥用。不過，橘梗根藥效很強，容易一喝就想吐，最好和甘草一起煎汁服用。3克的橘梗根加2克的甘草和300克的水，煎至半量，除去渣滓。飲用時，先漱口，再喝。
橘梗的根有藥效，可消炎、化痰、排膿(擠出膿)。
